Praprotnik je skupaj s predsednikom KPK Goranom Klemenčičem in namestnico Liljano Selinšek z vrha KPK odstopil konec novembra lani. Za to so se odločili bojda iz protesta, prvak opozicije Janez Janša pa je takrat dejal, da ko bi morali začeti preiskovati korupcijo v bankah, so raje odstopili.
Izbira Praprotnika za delo v NLB je pravzaprav na moč bizarna. V slaba posojila NLB se KPK pod prejšnjim vodstvom Gorana Klemenčiča resno sploh ni spuščala, niti ni v svoj urad vabila na zaslišanje nikogar od bankirjev te največje državne banke. Le pred letom dni je spisala neko načelno poročilo o oceni bančnega sistema z vidika korupcijskih tveganj, kjer pa seveda ni izpostavila prav nobenega imena, niti iz NLB, niti iz NKBM.